ജനിതക വിശകലനങ്ങൾ ചക്രവാളത്തിൽ പുതിയ വൈറസുകൾ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു

അസംബ്ലി ഗുണനിലവാര വിലയിരുത്തൽ. (എ) മീസ് (ഇടത്), മൈക്കോ (വലത്) അസംബ്ലി നിലവാര മെട്രിക്‌സ് എങ്ങനെ കണക്കാക്കുന്നു എന്ന് ദൃശ്യവൽക്കരിക്കുന്ന കളിപ്പാട്ട ഉദാഹരണം. Meas-ന് ഉപയോഗിക്കുന്ന അലൈൻമെൻ്റ് സ്‌കോറുകൾ Bowtie2 ഉപയോഗിച്ചാണ് കണക്കാക്കിയത്, പൊരുത്തക്കേടുകളില്ലാതെ പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യം വിന്യസിക്കുന്ന റീഡുകൾക്ക് അനുയോജ്യമായ പൂജ്യത്തിൻ്റെ പരമാവധി മൂല്യമുണ്ട്. (ബി) ഈ പഠനത്തിൽ കണ്ടെത്തിയതും കൂട്ടിച്ചേർത്തതുമായ നിഡോവൈറൽ സീക്വൻസുകൾക്കും (പച്ച), 2,350 റഫറൻസ് ആർഎൻഎ വൈറസ് സീക്വൻസുകൾക്കും (ഗ്രേ) ലഭിച്ച മീസ്, മൈക്കോ മൂല്യങ്ങൾ എന്നിവയുടെ വിതരണം. രണ്ട് x-അക്ഷങ്ങളും ലോഗിലാണ്10 സ്കെയിൽ. കടപ്പാട്: PLOS രോഗകാരികൾ (2024). DOI: 10.1371/journal.ppat.1012163

പെട്ടെന്ന് അവ പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു, SARS-CoV-2 കൊറോണ വൈറസ് പോലെ, വലിയ പകർച്ചവ്യാധികൾക്ക് കാരണമാകും: ആർക്കും അവരുടെ റഡാറിൽ ഉണ്ടായിരുന്നില്ല. അവ യഥാർത്ഥത്തിൽ പുതിയതല്ല, പക്ഷേ അവ ജനിതകമായി മാറിയിരിക്കുന്നു. പ്രത്യേകിച്ചും, വിവിധ വൈറസ് സ്പീഷീസുകൾ തമ്മിലുള്ള ജനിതക വസ്തുക്കളുടെ കൈമാറ്റം ഗണ്യമായി മാറിയ സ്വഭാവസവിശേഷതകളുള്ള ഭീഷണിപ്പെടുത്തുന്ന രോഗകാരികളുടെ പെട്ടെന്നുള്ള ആവിർഭാവത്തിന് ഇടയാക്കും.

ഒരു അന്താരാഷ്ട്ര ഗവേഷക സംഘം നടത്തിയ നിലവിലെ ജനിതക വിശകലനങ്ങളാണ് ഇത് നിർദ്ദേശിക്കുന്നത്. ജർമ്മൻ കാൻസർ റിസർച്ച് സെൻ്ററിലെ (DKFZ) വൈറോളജിസ്റ്റുകൾ ജേണലിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച വലിയ തോതിലുള്ള പഠനത്തിന് നേതൃത്വം നൽകി. PLOS രോഗകാരികൾ.

“ഒരു പുതിയ കമ്പ്യൂട്ടർ സഹായത്തോടെയുള്ള വിശകലന രീതി ഉപയോഗിച്ച്, മത്സ്യം മുതൽ എലികൾ വരെയുള്ള വിവിധ കശേരുക്കളിൽ 13 കൊറോണ വൈറസുകൾ ഉൾപ്പെടെ, മുമ്പ് അറിയപ്പെടാത്ത 40 നിഡോവൈറസുകൾ ഞങ്ങൾ കണ്ടെത്തി,” DKFZ ഗ്രൂപ്പ് നേതാവ് സ്റ്റെഫാൻ സീറ്റ്സ് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നു. ഉയർന്ന പ്രവർത്തനക്ഷമതയുള്ള കമ്പ്യൂട്ടറുകളുടെ സഹായത്തോടെ, ഹാനോവറിലെ ഹെൽംഹോൾട്ട്സ് സെൻ്റർ ഫോർ ഇൻഫെക്ഷൻ റിസർച്ചിൽ നിന്നുള്ള ക്രിസ് ലോബറിൻ്റെ വർക്കിംഗ് ഗ്രൂപ്പും ഉൾപ്പെടുന്ന ഗവേഷണ സംഘം ഏകദേശം 300,000 ഡാറ്റാ സെറ്റുകൾ പരിശോധിച്ചു. വൈറോളജിസ്റ്റ് സെയ്റ്റ്‌സിൻ്റെ അഭിപ്രായത്തിൽ, നമുക്ക് ഇപ്പോൾ ഇത്രയും വലിയ അളവിലുള്ള ഡാറ്റ ഒരേസമയം വിശകലനം ചെയ്യാൻ കഴിയും എന്നത് തികച്ചും പുതിയ കാഴ്ചപ്പാടുകൾ തുറക്കുന്നു.

വൈറസ് ഗവേഷണം ഇപ്പോഴും അതിൻ്റെ ആപേക്ഷിക ശൈശവാവസ്ഥയിലാണ്. പ്രകൃതിയിൽ സംഭവിക്കുന്ന എല്ലാ വൈറസുകളുടെയും ഒരു ഭാഗം മാത്രമേ അറിയൂ, പ്രത്യേകിച്ച് മനുഷ്യരിലും വളർത്തുമൃഗങ്ങളിലും വിളകളിലും രോഗങ്ങൾ ഉണ്ടാക്കുന്നവ. അതിനാൽ പുതിയ രീതി സ്വാഭാവിക വൈറസ് റിസർവോയറുമായി ബന്ധപ്പെട്ട അറിവിൽ ഒരു കുതിച്ചുചാട്ടം വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. സ്റ്റെഫാൻ സെയ്‌റ്റ്‌സും സഹപ്രവർത്തകരും ശാസ്ത്രീയ ഡാറ്റാബേസുകളിൽ സംഭരിച്ചിരിക്കുന്ന കശേരുക്കളിൽ നിന്നുള്ള ജനിതക വിവരങ്ങൾ അവരുടെ ഉയർന്ന പ്രവർത്തനക്ഷമതയുള്ള കമ്പ്യൂട്ടറുകളിലൂടെ പുതിയ ചോദ്യങ്ങളുമായി അയച്ചു. വൈറൽ ജനിതക വസ്തുക്കൾ വലിയ തോതിൽ നേടുന്നതിനും പഠിക്കുന്നതിനുമായി അവർ വൈറസ് ബാധിച്ച മൃഗങ്ങളെ തിരഞ്ഞു. കൊറോണ വൈറസ് കുടുംബം ഉൾപ്പെടുന്ന നിഡോവൈറസുകൾ എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്നവയിലായിരുന്നു പ്രധാന ശ്രദ്ധ.

ആർഎൻഎ (റൈബോ ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ്) അടങ്ങിയ ജനിതക പദാർത്ഥമായ നിഡോവൈറസുകൾ കശേരുക്കളിൽ വ്യാപകമാണ്. ഈ സ്പീഷിസുകളാൽ സമ്പുഷ്ടമായ ഗ്രൂപ്പായ വൈറസുകൾക്ക് മറ്റെല്ലാ ആർഎൻഎ വൈറസുകളിൽ നിന്നും അവയെ വേർതിരിച്ച് അവയുടെ ബന്ധം രേഖപ്പെടുത്തുന്ന ചില പൊതു സ്വഭാവങ്ങളുണ്ട്. അല്ലാത്തപക്ഷം, നിഡോവൈറസുകൾ പരസ്പരം വളരെ വ്യത്യസ്തമാണ്, അതായത്, അവയുടെ ജീനോമിൻ്റെ വലിപ്പത്തിൻ്റെ കാര്യത്തിൽ.

പുതിയ വൈറസുകളുടെ ആവിർഭാവവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് ഒരു കണ്ടെത്തൽ വളരെ രസകരമാണ്: ഒരേസമയം വിവിധ വൈറസുകൾ ബാധിച്ച ആതിഥേയ മൃഗങ്ങളിൽ, വൈറസ് പകർപ്പെടുക്കുമ്പോൾ വൈറൽ ജീനുകളുടെ പുനഃസംയോജനം സംഭവിക്കാം.

“പ്രത്യക്ഷമായും, മത്സ്യങ്ങളിൽ ഞങ്ങൾ കണ്ടെത്തിയ നിഡോവൈറസുകൾ കുടുംബത്തിൻ്റെ അതിരുകൾക്കപ്പുറവും വിവിധ വൈറസ് സ്പീഷീസുകൾക്കിടയിൽ ജനിതക വസ്തുക്കൾ ഇടയ്ക്കിടെ കൈമാറുന്നു,” സെയ്റ്റ്സ് പറയുന്നു. വിദൂര ബന്ധുക്കൾ “ക്രോസ് ബ്രീഡ്” ചെയ്യുമ്പോൾ, ഇത് പൂർണ്ണമായും പുതിയ ഗുണങ്ങളുള്ള വൈറസുകളുടെ ആവിർഭാവത്തിലേക്ക് നയിച്ചേക്കാം. സെയ്‌റ്റ്‌സിൻ്റെ അഭിപ്രായത്തിൽ, അത്തരം പരിണാമ കുതിച്ചുചാട്ടങ്ങൾ വൈറസുകളുടെ ആക്രമണാത്മകതയെയും അപകടകരതയെയും ബാധിക്കും, മാത്രമല്ല ചില ആതിഥേയ മൃഗങ്ങളുമായുള്ള അവയുടെ ബന്ധത്തെയും ബാധിക്കും.

“മത്സ്യ വൈറസുകളിൽ നാം കണ്ടെത്തിയതുപോലെ ഒരു ജനിതക വിനിമയം, ഒരുപക്ഷേ സസ്തനി വൈറസുകളിലും സംഭവിക്കാം,” സെയ്റ്റ്സ് വിശദീകരിക്കുന്നു. വവ്വാലുകൾ – ഷ്രൂകൾ പോലെ – പലപ്പോഴും ധാരാളം വ്യത്യസ്ത വൈറസുകൾ ബാധിച്ചിരിക്കുന്നു, അവ ഒരു യഥാർത്ഥ ഉരുകൽ പാത്രമായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു. SARS-CoV-2 കൊറോണ വൈറസ് ഒരുപക്ഷേ വവ്വാലുകളിലും വികസിക്കുകയും അവിടെ നിന്ന് മനുഷ്യരിലേക്ക് കുതിക്കുകയും ചെയ്തു.

നിഡോവൈറസുകൾ തമ്മിലുള്ള ജീൻ കൈമാറ്റത്തിനുശേഷം, വൈറസുകൾ അവയുടെ ആതിഥേയ കോശങ്ങളിലേക്ക് ഡോക്ക് ചെയ്യുന്ന സ്പൈക്ക് പ്രോട്ടീൻ പലപ്പോഴും മാറുന്നു. പഠനത്തിൻ്റെ ആദ്യ രചയിതാവായ ക്രിസ് ലോബർ കുടുംബ വൃക്ഷ വിശകലനങ്ങളിലൂടെ ഇത് കാണിക്കാൻ കഴിഞ്ഞു. ഈ ആങ്കർ തന്മാത്രയെ പരിഷ്‌ക്കരിക്കുന്നതിലൂടെ വൈറസുകളുടെ ഗുണങ്ങളെ അവയുടെ ഗുണത്തിലേക്ക് ഗണ്യമായി മാറ്റാൻ കഴിയും-അവരുടെ പകർച്ചവ്യാധി വർദ്ധിപ്പിച്ച് അല്ലെങ്കിൽ ഹോസ്റ്റുകൾ മാറാൻ അവരെ പ്രാപ്‌തമാക്കുക.

കൊറോണ പാൻഡെമിക് ശക്തമായി പ്രകടമാക്കിയതുപോലെ, ആതിഥേയരുടെ മാറ്റം, പ്രത്യേകിച്ച് മൃഗങ്ങളിൽ നിന്ന് മനുഷ്യരിലേക്കുള്ള മാറ്റം, വൈറസിൻ്റെ വ്യാപനത്തെ വളരെയധികം സഹായിക്കുന്നു. വൈറൽ “ഗെയിം-ചേഞ്ചറുകൾ” എപ്പോൾ വേണമെങ്കിലും പെട്ടെന്ന് പ്രത്യക്ഷപ്പെടാം, ഇത് ഒരു വലിയ ഭീഷണിയായി മാറും, കൂടാതെ-തട്ടിയാൽ അത് ഒരു പകർച്ചവ്യാധിക്ക് കാരണമാകും. ആരംഭ പോയിൻ്റ് ഒരൊറ്റ ഇരട്ട-ബാധയുള്ള ഹോസ്റ്റ് മൃഗം ആകാം.

പുതിയ ഉയർന്ന പ്രവർത്തനക്ഷമതയുള്ള കമ്പ്യൂട്ടർ പ്രക്രിയ പുതിയ വൈറസുകളുടെ വ്യാപനം തടയാൻ സഹായിക്കും. മനുഷ്യർക്ക് അപകടകരമായേക്കാവുന്ന വൈറസ് വകഭേദങ്ങൾക്കായുള്ള ചിട്ടയായ തിരയൽ ഇത് പ്രാപ്തമാക്കുന്നു, സെയ്റ്റ്സ് വിശദീകരിക്കുന്നു.

ഡികെഎഫ്‌സെഡ് ഗവേഷകൻ തൻ്റെ പ്രത്യേക ഗവേഷണ മേഖലയായ വൈറസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട കാർസിനോജെനിസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് സാധ്യമായ മറ്റൊരു പ്രധാന ആപ്ലിക്കേഷൻ കാണുന്നു: “കാൻസർ രോഗികളെയോ പ്രതിരോധശേഷി കുറഞ്ഞവരെയോ വൈറസുകൾക്കായി വ്യവസ്ഥാപിതമായി പരിശോധിക്കുന്നതിന് പുതിയ ഹൈ പെർഫോമൻസ് കമ്പ്യൂട്ടിംഗ് (HPC) ഉപയോഗിക്കാമെന്ന് എനിക്ക് ഊഹിക്കാൻ കഴിയും. കാൻസറിന് കാരണമാവുന്നത് വൈറസുകളാണെന്ന് അറിയാം, ഏറ്റവും മികച്ച ഉദാഹരണം ഹ്യൂമൻ പാപ്പിലോമ വൈറസുകളാണ്. മനുഷ്യ ശരീരവും മാരകമായ മുഴകളുടെ സാധ്യതയും വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു.”

അവലംബം: ജനിതക വിശകലനങ്ങൾ ചക്രവാളത്തിൽ പുതിയ വൈറസുകൾ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു (2024, മെയ് 13) https://phys.org/news/2024-05-genetic-analyses-reveal-viruses-horizon.html എന്നതിൽ നിന്ന് 2024 മെയ് 16 ന് വീണ്ടെടുത്തു

ഈ പ്രമാണം പകർപ്പവകാശത്തിന് വിധേയമാണ്. സ്വകാര്യ പഠനത്തിനോ ഗവേഷണത്തിനോ വേണ്ടിയുള്ള ന്യായമായ ഇടപാടുകൾ ഒഴികെ, രേഖാമൂലമുള്ള അനുമതിയില്ലാതെ ഒരു ഭാഗവും പുനർനിർമ്മിക്കാൻ പാടില്ല. ഉള്ളടക്കം വിവര ആവശ്യങ്ങൾക്കായി മാത്രമാണ് നൽകിയിരിക്കുന്നത്.

Click to rate this post!
[Total: 0 Average: 0]
[

Leave a Comment

Scroll to Top